Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1eQ9JMK2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms