Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdc42ep4Q9JM96 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms