Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrfQ9JM73 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms