Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Higd1aQ9JLR9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1aQ9JLR9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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