Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Col5a3Q9JLI2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col5a3Q9JLI2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms