Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms