Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg3Q9JL95 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms