Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gde1Q9JL56 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gde1Q9JL56 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gde1Q9JL56 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gde1Q9JL56 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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