Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hmgn5Q9JL35 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgn5Q9JL35 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms