Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot9Q9JKY0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms