Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfr2Q9JKX3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms