Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp4Q9JKV5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms