Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trem1Q9JKE2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trem1Q9JKE2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trem1Q9JKE2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trem1Q9JKE2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trem1Q9JKE2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trem1Q9JKE2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trem1Q9JKE2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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