Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms