Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uchl3Q9JKB1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms