Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6bQ9JK83 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6bQ9JK83 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms