Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK23

Psmg1, Proteasome assembly chaperone 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg1Q9JK23 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmg1Q9JK23 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psmg1Q9JK23 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms