Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ube2j1Q9JJZ4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ube2j1Q9JJZ4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ube2j1Q9JJZ4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ube2j1Q9JJZ4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ube2j1Q9JJZ4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2j1Q9JJZ4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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