Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms