Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms