Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc86Q9JJ89 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc86Q9JJ89 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms