Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc22Q9JIG7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc22Q9JIG7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms