Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gtf2ird1Q9JI57 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms