Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms