Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms