Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms