Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim2Q9ESN6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim2Q9ESN6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 275.5 ms