Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ropn1Q9ESG2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ropn1Q9ESG2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ropn1Q9ESG2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ropn1Q9ESG2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ropn1Q9ESG2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ropn1Q9ESG2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ropn1Q9ESG2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms