Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtofQ9ESF1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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