Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap29Q9ERB0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms