Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dap3Q9ER88 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dap3Q9ER88 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dap3Q9ER88 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms