Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rapgef4Q9EQZ6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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