Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vmn1r29Q9EQ41 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r29Q9EQ41 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r29Q9EQ41 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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