Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpv4Q9EPK8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv4Q9EPK8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms