Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpr88Q9EPB7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms