Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TnmdQ9EP64 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TnmdQ9EP64 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms