Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl4Q9DCU6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms