Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pop7Q9DCH2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pop7Q9DCH2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pop7Q9DCH2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pop7Q9DCH2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms