Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trmt112Q9DCG9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms