Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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