Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syde1Q9DBZ9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms