Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX3

Susd2, Sushi domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd2Q9DBX3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Susd2Q9DBX3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms