Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pop5Q9DB28 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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