Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf4Q9DAW6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf4Q9DAW6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms