Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Smco2Q9DA21 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms