Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms