Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph9Q9D9V4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph9Q9D9V4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms