Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib4Q9D9N5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms