Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms