Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx5Q9D8U8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx5Q9D8U8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms